ABI 394型DNA/RNA合成仪的基本参数：
合成柱数：4
通量（同时合成产物）：4
在线脱保护监测：4个Trityl在线监测器
合成产物种类：DNA、RNA、LNA荧光标记/探针、甲基化、硫代等
合成周期（20bp）：2小时
耦合率：99%
产物长度：150bp
合成产物规模：10μmol
产物承载方式：合成柱
碱基瓶位：8
试剂瓶位：8
碱基驱动方式：微型液体电磁阀
试剂驱动方式：微型气体电磁阀
试剂通用性：通用
所需气体：氮气/氩气
软件版本：V 2.0 or higher
其它功能：自带氨水可实现自动氨解
ABI 394引物合成仪可自动完成单链引物合成的全过程，其继承了392引物合成仪的高合成能力，可同时执行合成4条寡核苷酸的任务，使用更大的原料瓶，操作简单。
ABI 394合成仪的使用亚磷酰胺三酯法合成DNA片段，具有高效、快速的偶联以及起始反应物比较稳定的特点。亚磷酰胺三酯法是将DNA固定在固相载体上完成DNA链的合成的，合成的方向是由待合成引物的3'端向5'端合成的，相邻的核苷酸通过3'→5'磷酸二酯键连接。
步是将预先连接在固相载体CPG上的活性基团被保护的核苷酸与三氯乙酸反应，脱去其5'-羟基的保护基团DMT，获得游离的5'-羟基；
第二步，合成DNA的原料，亚磷酰胺保护核苷酸单体，与活化剂四氮唑混合，得到核苷亚磷酸活化中间体，它的3'端被活化，5'-羟基仍然被DMT保护，与溶液中游离的5'-羟基发生缩合反应。
第三步，盖帽(capping)反应，缩合反应中可能有极少数5'-羟基没有参加反应(少于2%)，用乙酸酐和1-甲基咪唑终止其后继续发生反应，这种短片段可以在纯化时分离掉。
第四步，在氧化剂碘的作用下，亚磷酰形式转变为更稳定的磷酸三酯。
经过以上四个步骤，一个脱氧核苷酸被连接到固相载体的核苷酸上。再以三氯乙酸脱去它的5'-羟基上的保护基团DMT，重复以上步骤，直到所有要求合成的碱基被接上去。
ABI 394合成仪由与系统配套的软件控制。合成前，可根据合成目的，预先进行软件程序设置。
ABI 394合成仪具有自动分析特性。通过软件的系统设置，利用废液检测器，可根据收集的反应完试剂产生的废液颜色判断已完成合成的引物合成效果，不仅能够检测已完成反应的效果，而且能够及时阻断效率低的合成，从而避免反应试剂的浪费。
