臭氧 (O3)是氧气(O2)的同素异构体。在水中时刻发生还原反应,产生中间物质单原子氧(O)和羟基(OH)。单原子氧(O)氧化能力强。羟基(OH)是强氧化剂,催化剂,羟基的氧化还原电位为2.80V,是已知强的氧化剂----氟的氧化能力相当。它可以分解一般氧化剂破坏的物。单原子氧(O)和羟基(OH)还能分解细菌的细胞壁,扩散进入细胞内,氧化破坏细胞内的酶,割断其核酸,而致病菌。
还有人认为,河南臭氧发生器可与细菌细胞壁脂类双键反应。穿入细菌体内部,作用于脂蛋白和脂多糖,改变细胞的通透性,从而导致细胞溶解,因此它起到,分解污染物质的作用比氯高出几,反应之后,变成氧或生成水不产生二次污染。