LTQ Orbitrap是整合了LTQ线性离子阱质谱仪和轨道阱质量分析器的组合式高分辨质谱仪系统。大气压离子源处产生的离子在LTQ质量分析器被捕获。而一旦处于离子阱中，这些离子就可以通过LTQ的MS或MSn等扫描模式进行分析。然后，离子从LTQ轴向排出，进入一个C-形离子阱(C-trap)，再经过C-trap进入Orbitrap质量分析器。通过快速增加Orbitrap中心电极的电压可将C-trap来的离子捕获，捕获的离子围绕中心电极做环形运动并沿中心电极轴向振动。
来自轨道阱外电极的信号经过扩增后，通过快速傅立叶变换转换为频率。另外LTQ Orbitrap XL还有一个新型碰撞池能够提供任何的二级质谱实验。离子被选择性的保留在线性离子阱中，可以通过离子阱碰撞诱导解离技术或者新型高能诱导技术断裂。高能碰撞诱导解离离子经过C-trap到达充满气体的碰撞池。高能诱导解离的二级质谱实验中，标准化的碰撞能量可以在不同的仪器之间提供重复的数据。
LTQ ORBITRAP XL提供
高质量准确度，低假阳性率
高灵敏度，宽动态范围可鉴定更多的蛋白
高效的平行检测模式
二级质谱高灵敏度
可以升级的组件包括电子转移裂解(ETD) 和MALDI功能
技术参数：
LTQ Orbitrap XL ETD提供：
利用多重活化类型（activation types)和数据依赖决策树（Data Dependent Decision Tree）的高度可靠的蛋白质鉴定功能。
平行获取能力和高通量测序应用
利用高分辨率和高精密度的质谱鉴定未预期的PTMs
广范围定量性能，包括低丰度肽段
对于大肽段和蛋白质分析：
高分辨率和高质谱保障复杂ETD谱图分析
为前体和碎片离子提供清晰的电荷状态鉴定
ProSigntPC软件适用于自动数据挖掘（Data Mining)
通过LC/MS为肽段测序进行数据依赖决策树（Data Dependent Decision Tree）分析
增加鉴定的肽段数目而不增加实验时间
根据肽段特性（电荷状态，荷质比m/z等等）自动提供优化的碎片解离技术选择，确保达到效解离
Proteome Discoverer 软件平台提供定性和定量数据分析
互补性的ETD、CID和HCD分析提供清晰的从头测序
主要特点：
基于快速、高灵敏的Thermo Scientific 线性离子阱和自主的Orbitrap技术，LTQ Orbitrap XL组合型傅立叶变换高分辨质谱无论是对常规化合物鉴定，还是严格复杂体系内痕量组分的分析，都能应对自如。
LTQ ORBITRAP XL –超凡的性能和易用性
新型高能碰撞诱导解离池对于蛋白质组学和小分子研究及其方便易用
可以升级的组件包括电子转移裂解(ETD) 和MALDI功能
Thermo Scientific LTQ Orbitrap XL ETD组合型傅里叶变换高分辨质谱仪是当前用于蛋白质分析的有效仪器，完美地将三种不同而具有互补性的碎片解离技术---CID, HCD和ETD能集于一身。
基于深受赞誉的Orbitrap技术，Thermo Scientific LTQ Orbitrap XL ETD组合型傅里叶变换高分辨质谱仪为蛋白质分析的各项需求提供了全面的解决方案，包括：复杂PTM分析、肽段智能测序、从上到下（top-down）和从中到下（middle-down）分析，和通过稳定同位素标记如：TMT、iTRAQ进行蛋白质定量分析或者无标记蛋白质定量分析等等。